Duhové pyramidy obsahují také všechny barvy čaker, pouze nejsou pravidelně uspořádány. Nicméně lze je použít stejným způsobem, jako pyramidy čakrové.
Vždy, když chcete vyčistit čakry, odstranit bloky a uvlonit energetické dráhy, poproste pyramidu (nebo jehlan) a uvloněte se. Soustřeďte se na své pocity a nechte ji pracovat. Můžete se také uvést do meditačního stavu a pozorovat, jak pracuje, případně i pomoct pomocí vizualizace.